DATOS DEL PROFESOR
Nombre SORZANO SANCHEZ, CARLOS OSCAR Correo electrónico coss.eps@ceu.es
Facultad Escuela Politécnica Superior Departamento Tecnologías de la Información
Sección Área de conocimiento Teoría de la Señal y Comunicaciones
Teléfono 913726444 Extensión 4969
ASIGNATURAS IMPARTIDAS
Tratamiento Digital de Imágenes
ACTIVIDADES ANTERIORES DE CARÁCTER CIENTÍFICO O PROFESIONAL
PuestoInstituciónDesdeHasta
Technical Director Instruct Image Processing Center 01/11/2009
Profesor Agregado Univ. San Pablo CEU 01/04/2009
Investigador Senior Centro Nacional de Biotecnología (CSIC) 01/11/2008 01/11/2009
Profesor Adjunto Univ. San Pablo CEU 01/10/2004 01/04/2009
Asistente de Investigación Swiss Federal Institute of Technology Lausanne (EPFL) 01/04/2003 01/03/2004
Becario postdoctoral Centro Nacional de Biotecnología (CSIC) 07/06/2002 01/03/2003
Profesor colaborador Univ. San Pablo CEU 01/09/2001 01/09/2004
Becario predoctoral Centro Nacional de Biotecnología (CSIC) 15/10/1997 06/06/2002
PARTICIPACIÓN EN PROYECTOS DE INVESTIGACIÓN FINANCIADOS

Título del proyecto Procesamiento tridimensional de imagen robusto y automatizado en Biología Estructural
Entidad financiadora Ministerio de Economía y Competitividad
Referencia BIO2013-44647-R
Fecha de inicio 01/01/2014
Fecha de fin 31/12/2016

Título del proyecto Four-dimensional transmission electron microscopy of macromolecular assemblies
Entidad financiadora CSIC
Referencia 2012FR01
Número de investigadores 2
Entidades participantes CSIC, CNRS
Fecha de inicio 01/01/2012
Fecha de fin 31/12/2014
Investigador principal C.O.S. Sorzano

Título del proyecto Comienzo de la fase operativa del Instruct Image Processing Center
Entidad financiadora Ministerio de Ciencia e Innovación
Referencia AIC-A-2011-0638
Número de investigadores 3
Entidades participantes CSIC
Fecha de inicio 01/12/2011
Fecha de fin 01/12/2014
Investigador principal J.M.Carazo

Título del proyecto Comienzo de la fase operativa del Instruct Image Processing Center
Entidad financiadora Ministerio de Ciencia e Innovación
Referencia AIC-A-2011-0638
Número de investigadores 3
Entidades participantes CSIC
Fecha de inicio 01/12/2011
Fecha de fin 01/12/2014
Investigador principal J.M.Carazo

Título del proyecto Hacia luna Microscopía electrónica tridimensional de alto rendimiento.
Entidad financiadora Ministerio de Ciencia e Innovación
Referencia BIO2010-16566
Fecha de inicio 01/01/2011
Fecha de fin 31/12/2013
Investigador principal J.M. Carazo

Título del proyecto Hacia luna Microscopía electrónica tridimensional de alto rendimiento.
Entidad financiadora Ministerio de Ciencia e Innovación
Referencia BIO2010-16566
Fecha de inicio 01/01/2011
Fecha de fin 31/12/2013
Investigador principal J.M. Carazo

Título del proyecto Puesta en marcha del Centro Asociado INSTRUCT en procesamiento de imágenes en Microscopía.
Entidad financiadora Ministerio de Ciencia e Innovación
Referencia ACI2010-1088
Fecha de inicio 01/01/2011
Fecha de fin 31/12/2011
Investigador principal J.M. Carazo

Título del proyecto Parallel-Scalable Single-Particle Analysis in 3D Electron Microscopy
Entidad financiadora EU
Referencia FP6 project RI-031513 and the FP7 project RI-22291
Fecha de inicio 01/10/2010
Fecha de fin 30/04/2011
Investigador principal C.O.S. Sorzano

Título del proyecto Associated Center for Image Processing in Microscopy for Structural Biology
Entidad financiadora Ministerio de Ciencia e Innovación
Referencia ACI2009-1022
Fecha de inicio 01/01/2010
Fecha de fin 31/12/2010
Investigador principal J.M. Carazo

Título del proyecto Four-dimensional cryo-transmission electron microscopy of large macromolecular assemblies
Entidad financiadora CSIC
Referencia 2009FR0015
Fecha de inicio 01/01/2010
Fecha de fin 31/12/2010
Investigador principal C.O.S. Sorzano

Título del proyecto Tomografía de rayos X: una herramienta de integración entre biología molecular y celular
Entidad financiadora CSIC, Proyecto Intramural de Frontera
Referencia PIF08-020
Fecha de inicio 01/06/2008
Fecha de fin 01/06/2010
Investigador principal J.M. Carazo

Título del proyecto Consorcio para el Desarrollo de Tecnología Avanzada de Imagen Médica (CDTEAM, Proyecto Cénit)
Entidad financiadora Ministerio de Educación y Ciencia
Fecha de inicio 01/09/2007
Fecha de fin 31/08/2009
Investigador principal M. Desco

Título del proyecto Herramientas para el análisis y estudio de registros polisomnográficos de pacientes con alteraciones cardiopulmonares del sueño
Entidad financiadora CEU
Referencia USP-PPC 04/07
Fecha de inicio 01/09/2007
Fecha de fin 31/08/2009
Investigador principal A. Otero

Título del proyecto Análisis de grandes cantidades de imágenes de microscopia electrónica tridimensional: desarrollo de métodos y aplicación al análisis del replisoma
Entidad financiadora Ministerio de Educación y Ciencia
Referencia BIO2007-67150-C03-1
Fecha de inicio 01/01/2007
Fecha de fin 31/03/2010
Investigador principal J.M. Carazo

Título del proyecto Hacia la proteómica funcional: una aproximación conjunta desde la proteómica, la bioinformática y la biología estructural
Entidad financiadora Comunidad de Madrid
Referencia S-GEN-0166-2006
Fecha de inicio 01/01/2007
Fecha de fin 31/12/2011
Investigador principal J.M. Carazo

Título del proyecto Centrosoma 3D (Proyecto Consolider)
Entidad financiadora Ministerio de Educación y Ciencia
Referencia CSD2006-00023
Fecha de inicio 01/11/2006
Fecha de fin 30/10/2009
Investigador principal L. Serrano

Título del proyecto Técnicas de procesamiento de señales multidimensionales aplicadas a biología estructural mediante microscopía electrónica
Entidad financiadora CEU
Referencia PC 14/05
Fecha de inicio 01/09/2005
Fecha de fin 01/09/2006
Investigador principal C.O.S. Sorzano

Título del proyecto Reconstrucción tridimensional de alta resolución en cámaras PET para animales pequeños
Entidad financiadora FIS
Referencia PI040683
Fecha de inicio 01/03/2005
Fecha de fin 01/03/2008
Investigador principal R. Marabini

Título del proyecto Image Processing in Biological 3D Electron Microscopy
Entidad financiadora NIH
Referencia 5R01HL070472-07
Fecha de inicio 01/01/2005
Fecha de fin 31/08/2009
Investigador principal G. Herman y J.M. Carazo

Título del proyecto Técnicas de procesamiento de señales multidimensionales aplicadas a biología estructural mediante microscopía electrónica
Entidad financiadora Comunidad de Madrid
Referencia GR/SAL/0342/2004
Fecha de inicio 01/01/2005
Fecha de fin 01/01/2006
Investigador principal C.O.S. Sorzano

Título del proyecto Hacia la comprensión de la riqueza estructural de las nanomáquinas moleculares
Entidad financiadora CICYT
Referencia BFU2004-00217/BMC
Fecha de inicio 01/09/2004
Fecha de fin 01/09/2007
Investigador principal J. M. Carazo

Título del proyecto Generación automática de correspondencias entre ontologías con aplicación al análisis de bases de datos de genómica y proteómica
Entidad financiadora CEU
Referencia 08/04
Fecha de inicio 01/07/2004
Fecha de fin 01/07/2006
Investigador principal M. Fernández

Título del proyecto New electron microscopy approaches for studying protein complexes and cellular supramolecular architecture
Entidad financiadora UE
Referencia FP6-502828
Fecha de inicio 01/03/2004
Fecha de fin 01/03/2009
Investigador principal A. Engel

Título del proyecto IM3: Imagen Médica Molecular y Multimodalidad
Entidad financiadora FIS
Referencia G03/185
Fecha de inicio 01/01/2003
Fecha de fin 31/12/2005
Investigador principal M. Desco

Título del proyecto Desarrollo de técnica de eliminación de ruido en imágenes y aplicación a microscopía electrónica y astronomía
Entidad financiadora CEU
Referencia 17/02
Fecha de inicio 01/09/2002
Fecha de fin 01/09/2004
Investigador principal C.O.S. Sorzano

Título del proyecto Doped derivative-free algorithms for medical-image registration
Entidad financiadora Swiss National Science Foundation SNF
Referencia 2153-066938
Fecha de inicio 01/04/2002
Fecha de fin 31/03/2004
Investigador principal M. Bierlaire

Título del proyecto Análisis estructural a resolución media de macromoléculas biológicas: una aproximación conjunta desde la biología y la bioinformática estructural
Entidad financiadora CICYT
Referencia BIO2001-1237
Fecha de inicio 28/12/2001
Fecha de fin 27/12/2004
Investigador principal J.M.Carazo

Título del proyecto Image processing in biological 3D electron microscopy
Entidad financiadora NIH
Referencia 1R01HL67465-01
Fecha de inicio 01/09/2001
Fecha de fin 01/09/2005
Investigador principal G.T. Herman

Título del proyecto Integration of Information about Macromolecular Structure
Entidad financiadora EU
Referencia QLRI-CT-2000-31237
Fecha de inicio 01/10/2000
Fecha de fin 01/10/2003
Investigador principal Kim Henrick

Título del proyecto Replication initiation protein as new targets for bacterial growth inhibition (DNA Replication inhibitors)
Entidad financiadora EU
Referencia QLK2-2000-00634
Fecha de inicio 01/09/2000
Fecha de fin 01/09/2003
Investigador principal J.M. Carazo

Título del proyecto Reconstrucción tridimensional en microscopía electrónica: Organización de volúmenes en la base de datos Bioimage, desarrollo de nuevas metodologías en procesamiento de imagen y aplicación al estudio estructural de diversas helicasas hexaméricas
Entidad financiadora CICYT
Referencia Biotec., BIO 98-0761
Fecha de inicio 01/09/1998
Fecha de fin 01/09/2001
Investigador principal J.M. Carazo

Título del proyecto Desarrollo y aplicación al sistema de las helicasas hexaméricas de nuevas estrategias de reconstrucción tridimensional a resolución macromolecular
Entidad financiadora Ministerio Educación y Cultura / Soc. Max Planck
Fecha de inicio 01/01/1998
Fecha de fin 31/12/1999
Investigador principal J.M.Carazo

Título del proyecto Análisis estructural del antígeno T de SV40: Su caracterización estructural y el desarrollo de nuevas técnicas de procesamiento de imágenes multidimensionales
Entidad financiadora Comunidad de Madrid
Referencia CAM07B/0027/1997
Fecha de inicio 01/11/1997
Fecha de fin 01/11/1999
Investigador principal J.M. Carazo

Título del proyecto Bioimage: a european database of biological volume images
Entidad financiadora EU (BIOTEC)
Referencia PL960472
Fecha de inicio 01/12/1996
Fecha de fin 01/12/1999
Investigador principal J.M. Carazo

Título del proyecto Fully three-dimensional image reconstruction from transmission electron-microscopy projections
Entidad financiadora OTAN
Referencia CRG 960070
Fecha de inicio 01/03/1996
Fecha de fin 31/03/2000
Investigador principal J.M. Carazo
ESTANCIAS EN CENTROS EXTRANJEROS
ClaveTemáticaCentroLocalidadPaísDuraciónAño
Invitado Tomografía tridimensional en microscopía electrónica Laboratorio de Mineralogía y Cristalografía (Univ. Pierre et Marie Curie, Paris VI) París Francia 2 semanas 2013
Invitado Tomografía tridimensional en microscopía electrónica Institute Computational Mathematics and Scientific Computing Pekín China 2 semanas 2012
Invitado Tomografía tridimensional en microscopía electrónica Laboratorio de Mineralogía y Cristalografía (Univ. Pierre et Marie Curie, Paris VI) París Francia 2 semanas 2010
Invitado Tomografía tridimensional en microscopía electrónica Institute Computational Mathematics and Scientific Computing (Chinese Academy Sciences) Pekín China 4 semanas 2009
Invitado Tomografía tridimensional en microscopía electrónica Scripps Institute San Diego EE.UU. 4 semanas 2009
Invitado Tomografía tridimensional en microscopía electrónica Laboratorio de Imagen Integrativa, Instituto Curie París Francia 1 semana 2008
Invitado Tomografía tridimensional en microscopía electrónica Laboratorio de Mineralogía y Cristalografía (Univ. Pierre et Marie Curie, Paris VI) París Francia 2 semanas 2008
Invitado Tomografía tridimensional en microscopía electrónica Imperial College of London Londres Inglaterra 1 semana 2007
Invitado Tomografía tridimensional en microscopía electrónica Laboratorio de Imagen Integrativa, Instituto Curie París Francia 2 semanas 2007
Invitado Tomografía tridimensional en microscopía electrónica Laboratorio de Mineralogía y Cristalografía (Univ. Pierre et Marie Curie, Paris VI) París Francia 2 semanas 2007
Invitado Tomografía tridimensional en microscopía electrónica Max-Planck Institute of Biochemistry Martinsried Alemania 2 semanas 2007
Invitado Tomografía tridimensional en microscopía de rayos X National Center for X-ray Tomography (Lawrence Berkeley Nacional Laboratory) Berkeley EE.UU. 4 semanas 2006
Posdoctoral Tomografía tridimensional en microscopía electrónica Laboratorio de Imagen Integrativa, Instituto Curie París Francia 8 semanas 2005
Posdoctoral Tomografía tridimensional en microscopía electrónica Laboratorio de Mineralogía y Cristalografía (Univ. Pierre et Marie Curie, Paris VI) París Francia 8 semanas 2005
Contratado Tomografía tridimensional en microscopía electrónica Biomedical Imaging Group, Swiss Federal Institute of Technology Lausanne (EPFL) Lausanne Suiza 44 semanas 2003
Posdoctoral Tomografía tridimensional en microscopía electrónica Discrete Imaging Group, City University of New York Nueva York EE.UU. 8 semanas 2002
Doctorado Tomografía tridimensional en microscopía electrónica Center of Computer Science and Applied Mathematics, Univ. Temple Philadelphia EE.UU. 8 semanas 2000
Doctorado Tomografía tridimensional en microscopía electrónica Medical Imaging Processing Group (MIPG), Univ. Pennsylvania Philadelphia EE.UU. 4 semanas 1999
Doctorado Tomografía tridimensional en microscopía electrónica Max-Planck Institute of Biophysics Frankfurt Alemania 3 semanas 1998
CONGRESOS
TítuloTipo participaciónAutoresCongresoPublicaciónLugarAño
2D and 3D alignment for Electron Microscopy via Graphics Processing UnitsConferenciaE. García, M. Mateo, A. Deideri, C.O.S. Sorzano, A. Iriarte, G. CaffarenaInternational Work-Conference on Bioinformatics and Biomedical Engineering IWBBIO2014
Alignment of Direct Detector Device micrographs using a local least-squares approachOralV. Abrishami, J. Vargas, R. Marabini, J.M. Carazo, C.O.S. Sorzano18th Intl. Microscopy CongressRepública Cehca2014
Alignment of Direct Detector Device micrographs using a local least-squares approachConferenciaV. Abrishami, J. Vargas, R. Marabini, J.M. Carazo, C.O.S. Sorzano18th Intl. Microscopy Congress2014
CXCL2 and the actin cytoskeleton regulate CXCR4 lateral mobility and clusteringOralR. Barroso, C.O.S. Sorzano, J. Vargas, V. Rocha-Perugini, J.L. Rodríguez-Fernández, I. González, F. Sánchez-Madrid, L. Martínez-Muñoz, M. MelladoSIICA - SSAI Joint Workshop on Imaging the Immune SystemMilan, Italia2014
EFTEM-TomoJ : software for 3D chemical mapping by EFTEM and soft X-ray NEXAFS tomographyPósterC. Messaoudi, N. Aschman N, M. Cunha, T. Oikawa, C.O.S. Sorzano, J.J. Conesa, M. Chiappi, E. Pereiro, F.J. Chichón, J.L. Carrascosa, S. Marco18th Intl. Microscopy Congress2014
EFTEM-TomoJ : software for 3D chemical mapping by EFTEM and soft X-ray NEXAFS tomographyOralC. Messaoudi, N. Aschman N, M. Cunha, T. Oikawa, C.O.S. Sorzano, J.J. Conesa, M. Chiappi, E. Pereiro, F.J. Chichón, J.L. Carrascosa, S. Marco18th Intl. Microscopy CongressRepública Cehca2014
Outlier detection for single particle analysis in Electron MicroscopyConferenciaC.O.S. Sorzano, J. Vargas, J.M. de la Rosa-Trevín, A. Zaldívar-Peraza, J. Otón, V. Abrishami, I. Foche, R. Marabini, G. Caffarena, J.M. CarazoInternational Work-Conference on Bioinformatics and Biomedical Engineering, IWBBIO2014
Computational estimation of microRNA targets and binding site frequenciesPósterD.J. Martínez-Herrera, D. Tabas-Madrid, C.O.S. Sorzano, A. Pascual-MontanoAnnual Intl. Conf. Intelligent Systems for Molecular Biology2013
Integration of disparate sources of information to predict miRNA-mRNA interactionsPósterA. Muniategui, I. Sanchez-Caballero, R. Nogales-Cadenas, C.O.S. Sorzano, A. Pascual-Montano, A. RubioqPCR & NGS Symposium2013
Normal mode analysis for electron microscopy revitalizedPósterQ. Jin, C.O.S. Sorzano, J.M. Delarosa-Trevin, J.R. Bilbao-Castro, R. Núñez-Ramírez, O. Llorca, F. Tama, S. JonicGordon Research Conference: Three-dimensional Electron Microscopy2013
The use of the spiral phase transform in 3DEMConferenciaJ. Vargas, R. Marabini, J.M. de la Rosa-Trevín, A. Zaldívar-Peraza, J.M. Carazo, C.O.S. SorzanoMicroscopy at the frontiers of science2013
The use of the spiral phase transform in 3DEMConferenciaJ. Vargas, R. Marabini, J.M. de la Rosa-Trevín, A. Zaldívar-Peraza, J.M. Carazo, C.O.S. SorzanoGordon Research Conference: Three-dimensional Electron Microscopy2013
Three-dimensional reconstruction in Soft X-ray TomographyConferenciaJ. Otón, C.O.S. Sorzano, R. Marabini, J.M. CarazoAnnual Meeting of the Nordic Microscopy Society2013
Controlled experiment for evaluation of statistical models for data analysis in MetabolomicsT.O. Mendes, C.O.S. Sorzano, S. Angulo, M.J.V. Bell, F.J. Rupérez, C. BarbasXII Reunión Científica de la Sociedad Española de Técnicas de Cromatografía y Afines (SECYTA2012
Image processing for Cellular tomography using soft X-raysC.O.S. Sorzano, J. Otón, J. Cuenca, A. Zaldivar-Pérez, G. Caffarena, J. Sánchez-Jiménez, C. Messaoudi, S. Marco, R. Marabini, J.M. Carazo9th Intl. Symposium on Biomedical Imaging2012
Improving EFTEM 3D Chemical maps by multivariant statistical analysis and iterative denoisingC. Messaoudi, N. Ashman, M. Lyra Da Cunha, T. Oikawa, C.O.S. Sorzano, S. Marco15th European Microscopy Congress2012
Improving microRNA target prediction by performance-based algorithm combinationI. Sánchez-Caballero, A. Muniategui, R. Nogales-Cadenas, C.O.S. Sorzano, A. Rubio, A. Pascual-MontanoJornadas de Bioinformática2012
Java-C++ hybrid image processing using ImageJ: an example in electron and X-rays tomography Xmipp-TomoJC.O.S. Sorzano, J. Cuenca, J. Sánchez-Jiménez, C. Messaoudi, J.M. CarazoBioimage Analysis Workshop2012
Benchmarking and Standardization for 3D Electron MicroscopyR. Marabini, A. Quintana, C.O.S. Sorzano, J.M. CarazoGordon Research Conference2012
Quaternary structural flexibility of VirE2 is intrinsic and functionally relevant in DNA transfer by A. tumefaciensT. Bharat, S.G. Wolf, D. Zbaida, C.O.S. Sorzano, M. Eisenstein, M. ElbaumMeeting of the Israel Soc. for Microscopy2012
Quaternary structural flexibility of VirE2 is intrinsic and functionally relevant in DNA transfer by A. tumefaciensT. Bharat, S.G. Wolf, D. Zbaida, C.O.S. Sorzano, M. Eisenstein, M. ElbaumMeeting of the Israel Soc. for Microscopy2012
Scipion: Towards electron microscopy integrationA. Quintana, J. Vargas, A. Poza, J.R. Macías, R. Marabini, C.O.S. Sorzano, J. M.CarazoJornadas de Bioinformática2012
Three-dimensional Electron Microscopy: Current challengesC.O.S. Sorzano, R. Marabini. J.M. Carazo.Workshop on BioNMR2012
Xmipp 3.0: Advances in image processing for 3D Electron Microscopy of Single ParticlesJ.M. de la Rosa-Trevín, R. Marabini, J. Otón, A. Zaldívar-Peraza, J. Vargas, J.M. Carazo, C.O.S. SorzanoGordon Research Conference2012
X-ray Cellular Tomography: How the images are formed and how the volumes should be reconstructedR. Marabini, J. Otón, C.O.S. Sorzano, J.M. Carazo2nd Microscopy Congress of the Portuguese and Spanish Societies2011
A candidate HIV/AIDS vaccine (MVA-B) that enhances the magnitude and polyfunctionality of memory HIV-1-specific T-cell responsesPósterJ. García-Arriaza, J.L. Nájera, C.E. Gómez, N. Tewabe, C.O.S. Sorzano, T. Calandra, T. Roger, M. EstebanAIDS Vaccine 2011
A recombinant Vaccinia virus-based T cell vaccine against influenza virus reduces lung viral load upon virus challengeConferenciaA.G. Goodman, S. Guerra, A. Vijayan, P.P. Heinen, C.O.S. Sorzano, M. EstebanGene and Cell Therapy ConferenceEE.UU.2011
Acceleration of Electron Microscopy applications with GPGPUs and FPGAsConferenciaA. Deideri, G. Caffarena, J.A. López, C.O.S. SorzanoXI Jornadas de Computación Reconfigurable y AplicacionesTenerife, España2011
Xmipp 3.0: a specialized suite for image processing in microscopyConferenciaR. Marabini, J.M. de la Rosa-Trevín, J. Cuenca, A. E. Rey, J. Vega, J. Otón, C.O.S. Sorzano, J.M. Carazo2nd Microscopy Congress of the Portuguese and Spanish Societies Portugal2011
Xmipp 3.0: a specialized suite for image processing in microscopyR. Marabini, J.M. de la Rosa-Trevín, J. Cuenca, A. E. Rey, J. Vega, J. Otón, C.O.S. Sorzano, J.M. Carazo2nd Microscopy Congress of the Portuguese and Spanish Societies 2011
X-ray Cellular Tomography: How the images are formed and how the volumes should be reconstructedConferenciaR. Marabini, J. Otón, C.O.S. Sorzano, J.M. Carazo2nd Microscopy Congress of the Portuguese and Spanish SocietiesPortugal2011
X-ray Cellular Tomography: How the images are formed and how the volumes should be reconstructedConferenciaJ. Otón, R. Marabini, C.O.S.Sorzano, J.M.CarazoEMBL 6th Intl. Congress on Electron TomographyHeidelberg, Alemania2011
Benchmarking for 3D Electron MicroscopyConferenciaA. Quintana, C.O.S. Sorzano, R, Marabini, J.M. CarazoX Jornadas de BioinformáticaMálaga, España2010
Electric-potential reconstructions of single particles using L2-gradient flowsConferenciaL. Ming, G. Xu, C.O.S. Sorzano, C. Bajaj3rd Intl. Conf. on BioMedical Engineering and InformaticsYantai, China2010
First considerations on the reconstruction of X-ray tomographyConferenciaJ. Otón, C.O.S. Sorzano, J.M. Carazo, R. MarabiniIntl. Microscopy CongressRío de Janeiro, Brasil2010
Limitations in 3D reconstruction of X-ray tomographyConferenciaJ. Otón, R. Marabini, C.O.S. Sorzano, J.M. CarazoIntl. Microscopy CongressRío de Janeiro, Brasil2010
Structural analysis of the Mouse MCM4/6/7 helicase in complex with Cdt1PósterA. Álvarez-Cabrera, C.O.S. Sorzano, J. Busselez, R. González, Z. You, J.M. CarazoCongreso de la Soc. Española Bioquímica y Biología MolecularCórdoba, España2010
Understanding the dynamics of macromolecular machines by Three-Dimensional Electron Microscopy: The methods and some of their applicationsConferenciaJ.M. Carazo, S.H.W. Scheres, C.O.S. SorzanoAnnual meeting of the Nordic Microscopy Society ScandemEstocolmo, Suecia2010
X-ray tomography: an image formation modelConferenciaR. Marabini, J. Otón, R. Navarro, C.O.S. Sorzano, J.M. CarazoAnnual meeting of the Nordic Microscopy Society ScandemEstocolmo, Suecia2010
A hybrid method coupling normal mode analysis with projection matching to study structural flexibility of macromolecular assembliesPósterS. Jonic, C.O.S. Sorzano, F. Tama, E. Larquet, N. Boisset11th Congress of the French Society of MicroscopiesFrancia2009
Clustering of biomedical scientific papersConferenciaD. Bravo-Alcobendas, C.O.S. SorzanoIEEE Workshop on Intelligent Signal ProcessingBudapest, Hungría2009
Effects of the downsampling scheme on three-dimensional electron microscopy of single particlesConferenciaC.O.S. Sorzano, A. Iriarte, R. Marabini, J.M. CarazoIEEE Workshop on Intelligent Signal ProcessingBudapest, Hungría2009
Registration of electron tomography single-axis tilt series without fiducial markersConferenciaC.O.S. Sorzano, C. Messaoudi, M. Eibauer, R. Hegerl, R. Marabini, S. Nickell, S. Marco, J.M. CarazoJoint Spanish Portuguese Microscopy Congress215-216Segovia2009
Understanding the dynamics of macromolecular machines by Three-Dimensional Electron Microscopy: The methods and some of their applicationsConferenciaJ.M. Carazo, S.H.W. Scheres, C.O.S. SorzanoCritical Assessment of Predicted InteractionsBarcelona, España2009
A Fuzzy Constraint Satisfaction Approach to Identify and Characterize Apnea EpisodesComunicación oralA. Otero, C.O.S. Sorzano, E. Olmos, P. Félix, M.R. Álvarez, C. Zamarrón2nd Intl. Conference in Bioinformatics and Biomedical Engineering2024-2027Shanghai, China2008
A hybrid method coupling normal mode analysis with projection matching to study structural flexibility of macromolecular assembliesPósterS. Jonic, C.O.S. Sorzano, F. Tama, E. Larquet, N. BoissetGordon Research ConferenceItalia2008
bUnwarpJ: Consistent and elastic registration in ImageJ. Methods and applicationsPósterI. Arganda-Carreras, C.O.S. Sorzano, J. Kybic, C. Ortiz de SolórzanoImageJ Conference Users-DevelopersAustria2008
Flexible fitting of protein models into 3D-EM maps by using an image registration algorithmComunicación oralL. Fernández-de-Manuel, M.J. Ledesma-Carbayo, J. Atienza-Herrero, C.O.S. Sorzano, J.M. Carazo, A. SantosInternational Symposium on Structural Analysis of Supramolecular Assemblies by Hybrid MethodsLake Tahoe, CA, USA2008
Flexible image registration for the identification of best fitted protein models in 3D-EM mapsPósterL. Fernández-de-Manuel, M.J. Ledesma-Carbayo, J. Atienza-Herrero, C.O.S. Sorzano, J.M. Carazo, A. SantosIntl. Syposium on Biomedical Imaging983-986París, Francia2008
Neural networks for glucose prediction in continuous glucose monitoringPósterC. Pérez Gandía, M. E. Hernando, C.O.S. Sorzano, A. Otero Quintana, G. García Sáez, A. Rodríguez Herrero, B. M. Rigla, A. de Leiva, E. J. GómezAdvanced Technologies and treatments of diabetes ConferencePraga, Chequia2008
3D reconstruction of macromolecular assemblies at subnanometric resolutionComunicación oral (invitado)M. Cottevieille, S. Jonic, C.O.S. Sorzano, E. Larquet, N. Boisset3rd. Serbian congress of microscopyBelgrado, Serbia2007
3D transmission electron microscopy of biological nanomachinesComunicación oral (invitado)S. Jonic, C.O.S. Sorzano, N. Boisset3rd. Serbian congress of microscopyBelgrado, Serbia2007
Algoritmos estructurales basados en lógica borrosa para la identificación de apneas e hipoapneasComunicación oralA. Otero, P. Félix, J. M. Rodríguez, C. Zamarrón, C. Pérez-Gandía, C.O.S. SorzanoCongreso Anual de la Sociedad Ingeniería Biomédica (CASEIB)Cartagena, España2007
Enhanced diffractograms for image sorting and improvement of robustness and accuracy of CTF estimation: Application on high-resolution reconstruction of glutamate synthase and phosphorilase kinasePósterS. Jonic, C.O.S. Sorzano, M. Cottevieille, E. Larquet, C. Venien-Bryan, N. BoissetGordon conference of microscopyNew London, EE.UU.2007
Intelligent alarms for patient supervisionComunicación oralA. Otero, P. Félix, F. Palacios, C. Pérez-Gandía, C.O.S. Sorzano5th Intl. Syposium on Intelligent Signal Processing, WISP157-162Madrid, España2007
Mathematical models in image processingComunicación oral (invitado)C.O.S. Sorzano, M. C. Pérez-Gandía, A. Otero1st. Intl Congreso of Mathematics in Engineering and Architecture307-315Madrid, España2007
Consistent and elastic registration of histological sections using vector-spline regularizationComunicación oralI. Arganda-Carreras, C.O.S. Sorzano, R. Marabini, J.M. Carazo, C. Ortiz-de-Solórzano, J. Kybic2nd Intl. Workshop on Computer Vision Approaches to Medical Image Analysis, CVAMIA2006Graz, Austria2006
Elastic image registration with applications to ProteomicsComunicación oralC.O.S. Sorzano, P. Thévenaz, I. Valdés, A. Beloso, M. UnserVth Intl. Workshop on Information OpticsProc. of the Vth International Workshop on Information Optics: 300-309Toledo, Spain2006
Evaluation of multiple-axis tomography in Tomo-J, a freeware plugin for the Java based public software ImageJComunicación oralC. Messaoudi, S. Marco, C.O.S. Sorzano, T. BoudierConf. On ImageJLuxemburgo, Luxemburgo2006
Improvement of visibility of diffraction rings for classification of micrographs and their local areasPósterS. Jonic, C.O.S. Sorzano, M. Cottevieille, E. Larquet, N. BoissetGordon Research ConferenceIl Ciocco, Italia2006
Molecular image registration using mutual information and differential evolution optimizationComunicación oralB. Telenczuk, M. J. Ledesma-Carbayo, J. A Velazquez-Muriel, C.O.S. Sorzano, J.M. Carazo, A. SantosIEEE International Symposium on Biomedical ImagingWashington, USA2006
Nouvelle approche de visualisation et tri des diffractogrammes de cryo-MET basé sur l'anistropieComunicación oralS. Jonic, C.O.S. Sorzano, M. Cottevieille, E. Larquet, N. Boisset20th Conference of the French Biophysical Society171Anglet, Francia2006
Probabilidad de detección en cámaras PET de detectores continuosPósterA. Iriarte-Ruiz, R. Marabini, C.O.S. SorzanoCongreso Anual de la Sociedad Española de Ingeniería BiomédicaPamplona, España2006
TomoJ: new tools for electron tomographyComunicación oralC. Messaoudi, S. Halary, C.O.S. Sorzano, S. Marco, T. BoudierIntl. Microscopy CongressSapporo, Japón2006
A Software System for Automatic Generation of Ontology MappingsComunicación OralA. Sánchez-Alberca, R. García-García, C.O.S. Sorzano, C. Gutiérrez-Cossío, M. Chagoyen, M. Fernández-LópezWorkshop on Building and Applying Ontologies for the Semantic WebLisboa, Portugal2005
Grid computing in 3D Electron Microscopy Image Processing using XmippComunicación oralS.H.W. Scheres, A.J. Merino, C.O.S. Sorzano, J.M. Carazo18th IEEE Intl. Symposium on Computer-Based Medical Systems (CBMS)Dublín, Irlanda2005
Metodología de evaluación de modelos de predicción de glucemia en pacientes diabéticos basados en redes neuronalesComunicación oralC. Pérez Gandía, G. Garcia-Sáez, A. Rodríguez Herrero, M.E. Hernando Pérez, C.O.S. Sorzano, E.J. Gómez Aguilera, F. del Pozo GuerreroCongreso Anual de la Sociedad Española de Ingeniería Biomédica, CASEIB2005Madrid (España)2005
Note on "Wavelets, Gaussian mixtures and Wiener filtering".Artículo en proceedingsC.O.S. Sorzano, J. Rodrigo, E. Ortiz, M. LópezCongreso Anual de la Sociedad Española de Ingeniería Biomédica, CASEIB2005Madrid (España)2005
Relating discrete annotation schemes in the functional space through literature analysisPosterM. Chagoyen, C.O.S. Sorzano, P. Carmona-Sáez, J.M. Carazo, A. Pascual-MontanoIntl. Conf. on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB)Michigan, USA2005
Skeleton-based 3D reconstruction of histological sectionsPosterI. Arganda-Carreras, C.O.S. Sorzano, R. Marabini, J.M. Carazo, C. Ortiz-de-Solórzano9th Intl. Conf. on Information VisualizationLondres, Inglaterra2005
Spline-Based approach to orientation assignment for three-dimensional electron microscopyComunicación oralS. Jonic, C.O.S. Sorzano, P. Thévenaz, M. Unser, N. BoissetImaging for medical and life sciences Symposium (Imvie2)Vol I: 40-42Estrasburgo (Francia)2005
Algorithm for spline-based elastic registration in application to confocal images of gene expressionComunicación oralC.O.S.Sorzano, M. Blagov, P. Thévenaz, E. Myasnikova, M. Samsonova, M. Unser7th Intl. Conference on Pattern Recognition and Image AnalysisVol. 3: 928-931San Petersburgo (Rusia)2004
Framework for automatic generation of ontology mappingsComunicación oralG. Cañadas, M. Fernádez-López, R. García-García, M. Lama, A. Sánchez-Alberca, C.O.S. SorzanoJornadas Iberoamericanas de Ingeniería del Software e Ingeniería del ConocimientoMadrid (España)2004
Volumetric Spectral Signal-to-Noise RatioComunicación oralC.O.S.Sorzano, P. Thévenaz, S. Jonic, C. El-Bez, S. De Carlo, J. Conway, B. L. Trus, M. Unser13th European Microscopy CongressVol. I, 427-428Amberes (Bélgica)2004
Algebraic reconstruction of 2D crystals from their projectionsComunicación oralJ.M. Carazo, J.J. Fernández, G.T.Herman, S. Matej, R. Marabini, C.O.S. SorzanoRMSE-AMS joint conference689-692Sevilla (España)2003
Angular assignment in 3D Electron Microscopy using PCA and wavelet decompositionComunicación oralC.O.S. SorzanoRMSE-AMS joint conference689-692Sevilla (España)2003
Reconstruction by Chahine's method from Projections corrupted by Electron Microscope aberrationsComunicación oralG.T.Herman, R. Marabini, C.O.S. Sorzano, J. ZubelliRMSE-AMS joint conference689-692Sevilla (España)2003
2D ARMA models and parameter adjustment to estimate the CTF of the electron microscopePósterJ.A. Velázquez Muriel, C.O.S. Sorzano, J.J. Fernández, J. M. Carazo15th International Congress on Electron MicroscopyVol. 3, 433-434Durban (Sudáfrica)2002
3D Reconstruction of 2D crystals from projections in real spacePósterR. Marabini, C. O. S. Sorzano, J.J. Fernández, S. Matej, J.M. Carazo, G.T. Herman1st. International Symposium on Biomedical Imaging689-692Washington (EE.UU.)2002
New reconstruction conditions greatly improve the reconstruction qualityPósterC.O.S. Sorzano, R. Marabini, J. J. Fernández, J. A. Velázquez-Muriel, G. T. Herman, J. M. Carazo15th International Congress on Electron MicroscopyVol. 3, 431-432Durban (Sudáfrica)2002
Structural studies of SV40 large T-antigen on the origin of replicationPósterM.G. Gómez-Lorenzo, M. Valle, L.E. Donate, C. Gruss, M. Bárcena, C.O.S. Sorzano, J. Frank, J.M. Carazo15th International Congress on Electron MicroscopyVol. 2Durban (Sudáfrica)2002
Volumetric constraints in 3D tomography applied to electron microscopyPósterC.O.S. Sorzano, R. Marabini, G. T. Herman, J. M. Carazo1st. International Symposium on Biomedical Imaging641-644Washington (EE.UU.)2002
Method development of combination of atomic force and electron microscopy data to obtain better 3D reconstructionsPósterJ.A. Velázquez Muriel, C.O.S.Sorzano, J.M.CarazoSpanish, Portuguese and French Microscopy Societies meetingBarcelona (España)2001
Transfer function restoration in 3D electron microscopy via iterative data refinementPósterC.O.S.Sorzano, J.J. Fernández, R. Marabini, G.T. Herman, Y. Censor, J.M. CarazoInternational meeting on fully 3D image reconstruction in Radiology and Nuclear Medicine133-136Asilomar Center, California (EE.UU.) 2001
Towards more quantitative results from Three Dimensional Electron Microscopy of MacromoleculesComunicación oralJ.M. Carazo, N. Jimenez-Lozano, C.O.S. Sorzano, M. Chagoyen12th European Congress on Electron MicroscopyVol III (375-377)Brno (Chequia)2000
Quantitative comparison of 3D reconstruction algorithms under conditions of uneven angular distribution in electron microscopyPósterC.O.S.Sorzano, R. Marabini, N. Boisset, E.Rietzel, R.R.Schröder, G.T.Herman, J.M.CarazoInternational meeting on fully 3D image reconstruction in Radiology and Nuclear Medicine267-270Egmond aan Zee (Holanda)1999
Effects of uneven sampling in 3D reconstructionsPósterC.O.S. Sorzano, R. Marabini, J.M. Carazo, E. Rietzel, R.R. Schröder, G.T. Herman, N. Boisset14th International Congress on Electron MicroscopyVol I (771-772)Cancún (México)1998
Zero-loss P-contrast in EFTEMPósterE.Rietzel, P.Schorsch, H.Müller, R.Marabini, C.O.S.Sorzano, J.M.Carazo, U.Schimpf, C.Leue, K.C.Holmes, R.R.Schröder14th International Congress on Electron MicroscopyVol IV (421-422)Cancún (México)1998
TESIS DOCTORALES DIRIGIDAS
TítuloDoctorandoUniversidadFacultad/EscuelaCalificaciónMenciónAño
High resolution three-dimensional reconstruction for small animal PET camerasAna iriarte RuizUniv. Autónoma de MadridEscuela Politécnica SuperiorSobresaliente cum laude2012
OTROS MÉRITOS O ACLARACIONES QUE SE DESEE HACER CONSTAR

Hitos científicos:
• Premio Ángel Herrera de Investigación en el curso 2005/2006
• Director del Laboratorio de Bioingeniería de la Univ. San Pablo CEU desde 2007
• Director técnico del Instruct Image Processing Center desde 2009
• Miembro del Comité Ético de Experimentación Animal (CNB, CSIC) desde 2011.
• Miembro Senior IEEE desde 2008
• 2 Sexenios de investigación (1998-2003, 2004-2009)
• Revisor de proyectos de la ANEP desde 2006
Hitos académicos:
• Mejor expediente académico de Ing. Telecomunicación de la Promoción entrante en 91-92.
• Director de la Escuela de Verano en “Advanced Data Analysis and Modelling” (2006-2009)
• Codirector del Máster en Biotecnología Computacional de la Univ. San Pablo CEU en 2007-2009
• Secretario del Dept. de Ing. De Sistemas Electrónicos y de Telecomunicación en 2005-2008
• Coordinador del área de Teoría de la Señal y las Comunicaciones de la Univ. San Pablo CEU desde 2004 hasta 2011
• Acreditado por la ACAP como Profesor de Universidad Privada en 2005, por la ANECA como Profesor Titular de Universidad en 2009 y como Catedrático de Universidad en 2013
• Organizador en 2004 de la Reunión de Registro de Imagen de la Red Temática FIS en Imagen Médica, Molecular y Multimodalidad
• Organizador en 2005 de las Jornadas de Aplicación de Técnicas Computacionales a la Investigación Biomédica y Biotecnológica de la Univ. CEU San Pablo
• Organizador desde 2002 hasta 2007 de las Jornadas de Divulgación Científica de la Escuela Politécnica Superior de la Univ. CEU San Pablo con frecuencia anual
• Organizador desde 2002 hasta 2005 de las Jornadas de Tecnologías de la Información de la Escuela Politécnica Superior de la Univ. CEU San Pablo con frecuencia anual
• Organizador de la sesión de Bioingeniería del IEEE Intl. symposium of Intelligent Signal Processing (WISP, 2009)
• Organizador en 2013 de la IEEE Signal Processing Cup
• Dirección de 22 proyectos fin de carrera, 1 de ellos premiados como el mejor proyecto de la Escuela.
• Codirección de 3 tesis doctorales actualmente en curso
o J.M. de la Rosa Trevín, Algoritmos de obtención de volúmenes de referencia en microscopía electrónica de transmisión
o Vahid Abrishami, Algoritmos de reconocimiento de patrones y su aplicación a la microscopía electrónica de transmisión
o Ana Lucía Álvarez, Structural analysis of macromolecular nanomachines by 3D electron microscopy
Otros:
• Editor asociado de IEEE Signal Processing Magazine entre 2012 y 2013
• Editor asociado de BMC Structural Biology desde 2012
• Miembro de la Soc. Española de Microscopía, Soc. Europea de Microscopía, IEEE Communication Soc., IEEE Biomedical Soc., IEEE Signal Processing Soc.
• Revisor de las siguientes revistas: IEEE Trans. On Image Processing, IEEE Trans. On Medical Imaging, Intl. Journal of Adaptive Control and Signal Processing, Software: Practice & Experience, Pattern Recognition Letters, Inverse Problems in Science and Engineering, Inverse Problems, Computer Methods and Programs in Biomedicine, Journal of Structural Biology, Digital Signal Processing, Measurement Science and Technology, European Physical Journal, Bioinformatics
• Coordinador de la sección de investigación de la revista Bit del Colegio Oficial de Ingenieros de Telecomunicación entre 2007-2009
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